Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCBP4P57723 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms