Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC1A1P43005 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms