Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGP37231 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGP37231 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGP37231 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGP37231 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGP37231 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGP37231 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGP37231 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGP37231 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGP37231 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGP37231 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGP37231 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGP37231 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PPARGP37231 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPARGP37231 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPARGP37231 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms