Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LTBRP36941 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LTBRP36941 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms