Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXA13P31271 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms