Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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