Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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