Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSFA2P28290 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms