Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDHBP21953 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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