Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COL9A1P20849 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms