Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC025244.1-201ENST00000505930 469 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 LYRM2-204ENST00000520441 791 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AP001793.2-201ENST00000580267 780 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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HOXB3P14651 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC010834.3-201ENST00000520562 939 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC105430.1-202ENST00000567477 483 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXB3P14651 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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