Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX6O95503 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBX6O95503 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBX6O95503 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms