Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SEC22BO75396 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SEC22BO75396 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SEC22BO75396 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SEC22BO75396 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SEC22BO75396 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC22BO75396 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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