Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TIMM17BO60830 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TIMM17BO60830 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms