Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLXNC1O60486 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNC1O60486 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms