Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPLO60437 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPLO60437 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPLO60437 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms