Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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C4orf47A7E2U8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf47A7E2U8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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