Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWA8A3KMH1 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms