Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms