Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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CCDC88CQ9P219 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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CCDC88CQ9P219 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CCDC88CQ9P219 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CCDC88CQ9P219 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CCDC88CQ9P219 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CCDC88CQ9P219 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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CCDC88CQ9P219 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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CCDC88CQ9P219 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CCDC88CQ9P219 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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