Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NIFKQ9BYG3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIFKQ9BYG3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms