Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LPIN3Q9BQK8 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms