Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELF4Q99607 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms