Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP47Q96K76 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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USP47Q96K76 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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USP47Q96K76 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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USP47Q96K76 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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USP47Q96K76 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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USP47Q96K76 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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USP47Q96K76 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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USP47Q96K76 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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USP47Q96K76 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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USP47Q96K76 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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USP47Q96K76 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP47Q96K76 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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