Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
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