Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUB2Q96DC9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms