Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TOPBP1Q92547 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOPBP1Q92547 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms