Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3CQ92520 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM3CQ92520 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms