Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
HERVK_113Q902F9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HERVK_113Q902F9 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms