Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS4

CLHC1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1Q8NHS4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLHC1Q8NHS4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLHC1Q8NHS4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLHC1Q8NHS4 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLHC1Q8NHS4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLHC1Q8NHS4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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