Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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CLIP4Q8N3C7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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CLIP4Q8N3C7 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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CLIP4Q8N3C7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CLIP4Q8N3C7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CLIP4Q8N3C7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CLIP4Q8N3C7 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CLIP4Q8N3C7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CLIP4Q8N3C7 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CLIP4Q8N3C7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CLIP4Q8N3C7 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CLIP4Q8N3C7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CLIP4Q8N3C7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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