Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1M1

BEST3, Bestrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3Q8N1M1 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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BEST3Q8N1M1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST3Q8N1M1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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