Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NPAS3Q8IXF0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms