Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CATSPER4Q7RTX7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms