Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SDK2Q58EX2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms