Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KLHL22Q53GT1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms