Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 C12orf45-205ENST00000622317 1078 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 IGFL4-201ENST00000377697 573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 VSTM1-205ENST00000425006 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AL157823.2-201ENST00000452048 669 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 FXYD3-210ENST00000604621 548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC124944.3-201ENST00000607976 1304 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AL512328.1-203ENST00000428480 673 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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