Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM71Q2Q1W2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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