Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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