Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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SGCAQ16586 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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SGCAQ16586 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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SGCAQ16586 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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SGCAQ16586 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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SGCAQ16586 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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SGCAQ16586 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
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