Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIK5Q16478 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
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