Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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SSX1Q16384 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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SSX1Q16384 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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SSX1Q16384 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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SSX1Q16384 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SSX1Q16384 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SSX1Q16384 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SSX1Q16384 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SSX1Q16384 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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