Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZIC1Q15915 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms