Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCN9AQ15858 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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