Protein–RNA interactions for Protein: Q15648

MED1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED1Q15648 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MED1Q15648 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MED1Q15648 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MED1Q15648 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
MED1Q15648 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MED1Q15648 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MED1Q15648 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MED1Q15648 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED1Q15648 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED1Q15648 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED1Q15648 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED1Q15648 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED1Q15648 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MED1Q15648 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED1Q15648 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED1Q15648 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MED1Q15648 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED1Q15648 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED1Q15648 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED1Q15648 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED1Q15648 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED1Q15648 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED1Q15648 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED1Q15648 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MED1Q15648 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED1Q15648 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED1Q15648 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED1Q15648 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED1Q15648 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MED1Q15648 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MED1Q15648 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED1Q15648 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MED1Q15648 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED1Q15648 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED1Q15648 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED1Q15648 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED1Q15648 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MED1Q15648 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED1Q15648 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MED1Q15648 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED1Q15648 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED1Q15648 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED1Q15648 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED1Q15648 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MED1Q15648 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MED1Q15648 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MED1Q15648 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MED1Q15648 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MED1Q15648 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
MED1Q15648 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MED1Q15648 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED1Q15648 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MED1Q15648 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MED1Q15648 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED1Q15648 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MED1Q15648 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED1Q15648 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED1Q15648 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED1Q15648 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED1Q15648 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED1Q15648 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED1Q15648 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MED1Q15648 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MED1Q15648 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MED1Q15648 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MED1Q15648 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MED1Q15648 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MED1Q15648 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MED1Q15648 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MED1Q15648 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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