Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SKIV2LQ15477 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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