Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SHBQ15464 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SHBQ15464 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHBQ15464 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHBQ15464 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHBQ15464 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHBQ15464 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SHBQ15464 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms