Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PCOLCEQ15113 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCOLCEQ15113 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms