Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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