Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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GRIK3Q13003 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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GRIK3Q13003 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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GRIK3Q13003 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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GRIK3Q13003 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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GRIK3Q13003 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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